MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O7:K1 str. CE10 plasmid pCE10A

Total Repeats: 853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017647	ATT	2	6	10	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386627437
2	NC_017647	ATT	2	6	34	39	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386627437
3	NC_017647	CGG	2	6	150	155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627437
4	NC_017647	AGA	2	6	173	178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386627437
5	NC_017647	GCT	2	6	180	185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627437
6	NC_017647	GGT	2	6	242	247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627437
7	NC_017647	GTG	2	6	318	323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627437
8	NC_017647	GCG	2	6	375	380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627437
9	NC_017647	TTG	2	6	392	397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386627437
10	NC_017647	CAG	2	6	398	403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627437
11	NC_017647	GAT	2	6	412	417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627437
12	NC_017647	GCCA	2	8	418	425	25 %	0 %	25 %	50 %	386627437
13	NC_017647	TTC	2	6	455	460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386627437
14	NC_017647	AGGC	2	8	475	482	25 %	0 %	50 %	25 %	386627437
15	NC_017647	CTG	2	6	520	525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627437
16	NC_017647	ACA	2	6	550	555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386627437
17	NC_017647	CAG	2	6	565	570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627437
18	NC_017647	AAC	2	6	910	915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386627438
19	NC_017647	GAT	2	6	984	989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627438
20	NC_017647	GAAA	2	8	1052	1059	75 %	0 %	25 %	0 %	386627438
21	NC_017647	CAA	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386627439
22	NC_017647	TGC	2	6	1587	1592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627439
23	NC_017647	GCT	2	6	1612	1617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627439
24	NC_017647	CAC	2	6	1672	1677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386627439
25	NC_017647	TACC	2	8	1780	1787	25 %	25 %	0 %	50 %	386627439
26	NC_017647	CCGA	2	8	1823	1830	25 %	0 %	25 %	50 %	386627439
27	NC_017647	TGC	2	6	1855	1860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627439
28	NC_017647	GC	3	6	1892	1897	0 %	0 %	50 %	50 %	386627439
29	NC_017647	AAAC	2	8	1918	1925	75 %	0 %	0 %	25 %	386627439
30	NC_017647	CAGA	2	8	2015	2022	50 %	0 %	25 %	25 %	386627439
31	NC_017647	CGT	2	6	2057	2062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627439
32	NC_017647	CGT	2	6	2177	2182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627439
33	NC_017647	CATT	2	8	2559	2566	25 %	50 %	0 %	25 %	386627440
34	NC_017647	CCTGT	2	10	2589	2598	0 %	40 %	20 %	40 %	386627440
35	NC_017647	GACA	2	8	2600	2607	50 %	0 %	25 %	25 %	386627440
36	NC_017647	GCG	2	6	2629	2634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627440
37	NC_017647	ACA	2	6	2660	2665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386627440
38	NC_017647	ACA	2	6	3060	3065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386627441
39	NC_017647	GCC	2	6	3070	3075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386627441
40	NC_017647	A	6	6	3120	3125	100 %	0 %	0 %	0 %	386627441
41	NC_017647	CAC	2	6	3178	3183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386627441
42	NC_017647	CAT	2	6	3339	3344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386627442
43	NC_017647	GCTG	2	8	3405	3412	0 %	25 %	50 %	25 %	386627442
44	NC_017647	TC	3	6	3618	3623	0 %	50 %	0 %	50 %	386627442
45	NC_017647	CGT	2	6	3628	3633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627442
46	NC_017647	CAA	2	6	3672	3677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386627442
47	NC_017647	GAA	2	6	3681	3686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386627442
48	NC_017647	TCA	2	6	3704	3709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386627442
49	NC_017647	CG	3	6	3736	3741	0 %	0 %	50 %	50 %	386627442
50	NC_017647	TGCTC	2	10	3744	3753	0 %	40 %	20 %	40 %	386627442
51	NC_017647	AAC	2	6	3808	3813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386627442
52	NC_017647	CCA	2	6	3893	3898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386627442
53	NC_017647	AGGCC	2	10	3933	3942	20 %	0 %	40 %	40 %	386627442
54	NC_017647	TAT	2	6	3952	3957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386627442
55	NC_017647	CTGG	2	8	4073	4080	0 %	25 %	50 %	25 %	386627443
56	NC_017647	CAG	2	6	4100	4105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627443
57	NC_017647	CGG	2	6	4106	4111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627443
58	NC_017647	GC	3	6	4265	4270	0 %	0 %	50 %	50 %	386627443
59	NC_017647	TGT	2	6	4271	4276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386627443
60	NC_017647	CAT	2	6	4312	4317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386627443
61	NC_017647	TGA	2	6	4328	4333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627443
62	NC_017647	CAGC	2	8	4348	4355	25 %	0 %	25 %	50 %	386627443
63	NC_017647	CAT	2	6	4729	4734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386627444
64	NC_017647	CGA	2	6	4738	4743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627444
65	NC_017647	GAT	2	6	4744	4749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627444
66	NC_017647	GGT	2	6	4783	4788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627444
67	NC_017647	GAAA	2	8	4789	4796	75 %	0 %	25 %	0 %	386627444
68	NC_017647	GCTG	2	8	4831	4838	0 %	25 %	50 %	25 %	386627445
69	NC_017647	CTG	2	6	4863	4868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627445
70	NC_017647	CTG	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627445
71	NC_017647	CGC	2	6	4933	4938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386627445
72	NC_017647	GAA	2	6	4983	4988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386627445
73	NC_017647	TGC	2	6	4996	5001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627445
74	NC_017647	CAC	2	6	5039	5044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386627445
75	NC_017647	CGT	2	6	5159	5164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627445
76	NC_017647	GCG	2	6	5173	5178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627445
77	NC_017647	TGG	3	9	5221	5229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627445
78	NC_017647	GGT	2	6	5243	5248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627445
79	NC_017647	T	6	6	5518	5523	0 %	100 %	0 %	0 %	386627446
80	NC_017647	ATT	2	6	5570	5575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386627446
81	NC_017647	ATG	2	6	5585	5590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627446
82	NC_017647	GCG	3	9	5615	5623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627446
83	NC_017647	AGG	2	6	5667	5672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386627446
84	NC_017647	GGC	2	6	5680	5685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627446
85	NC_017647	TGA	2	6	5706	5711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627446
86	NC_017647	A	6	6	5729	5734	100 %	0 %	0 %	0 %	386627446
87	NC_017647	TAT	2	6	5761	5766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386627446
88	NC_017647	TGG	2	6	5799	5804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627446
89	NC_017647	GCA	2	6	5808	5813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627446
90	NC_017647	CG	3	6	5824	5829	0 %	0 %	50 %	50 %	386627446
91	NC_017647	AAT	2	6	5921	5926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386627446
92	NC_017647	CAG	2	6	5933	5938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627446
93	NC_017647	ATG	2	6	5975	5980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627446
94	NC_017647	TAT	3	9	6029	6037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386627446
95	NC_017647	ATT	2	6	6112	6117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386627446
96	NC_017647	ACT	2	6	6240	6245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386627446
97	NC_017647	TTG	2	6	6630	6635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386627447
98	NC_017647	CT	3	6	6640	6645	0 %	50 %	0 %	50 %	386627447
99	NC_017647	CGA	2	6	6679	6684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627447
100	NC_017647	TTGA	2	8	6696	6703	25 %	50 %	25 %	0 %	386627447
101	NC_017647	CGA	2	6	6758	6763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627447
102	NC_017647	GC	3	6	6765	6770	0 %	0 %	50 %	50 %	386627447
103	NC_017647	CG	3	6	6839	6844	0 %	0 %	50 %	50 %	386627447
104	NC_017647	A	6	6	6900	6905	100 %	0 %	0 %	0 %	386627447
105	NC_017647	CGCT	2	8	6907	6914	0 %	25 %	25 %	50 %	386627447
106	NC_017647	GC	3	6	6924	6929	0 %	0 %	50 %	50 %	386627447
107	NC_017647	TGG	2	6	6991	6996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627447
108	NC_017647	AGC	2	6	7003	7008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627447
109	NC_017647	GAC	2	6	7026	7031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627447
110	NC_017647	CGA	2	6	7067	7072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627447
111	NC_017647	CTG	2	6	7074	7079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627447
112	NC_017647	GAGATG	2	12	7170	7181	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386627447
113	NC_017647	GCC	2	6	7212	7217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386627447
114	NC_017647	CAA	2	6	7227	7232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386627447
115	NC_017647	GCT	2	6	7301	7306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627447
116	NC_017647	ACC	2	6	7341	7346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386627447
117	NC_017647	CAG	2	6	7356	7361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627447
118	NC_017647	ACA	2	6	7384	7389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386627447
119	NC_017647	CGG	3	9	7393	7401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627447
120	NC_017647	GAC	2	6	7436	7441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627447
121	NC_017647	GC	3	6	7473	7478	0 %	0 %	50 %	50 %	386627447
122	NC_017647	GCG	2	6	7486	7491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627447
123	NC_017647	GAA	2	6	7496	7501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386627447
124	NC_017647	TGA	2	6	7630	7635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627447
125	NC_017647	GC	3	6	7675	7680	0 %	0 %	50 %	50 %	386627447
126	NC_017647	GCGAAG	2	12	7717	7728	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386627447
127	NC_017647	CTG	2	6	7743	7748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627447
128	NC_017647	TGA	2	6	7759	7764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627447
129	NC_017647	GCT	2	6	7790	7795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627447
130	NC_017647	TTG	2	6	7798	7803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386627447
131	NC_017647	AAC	2	6	7830	7835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386627447
132	NC_017647	TCA	2	6	7894	7899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386627447
133	NC_017647	CCG	2	6	7900	7905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386627447
134	NC_017647	CTG	2	6	7950	7955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627447
135	NC_017647	CGT	2	6	7979	7984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627447
136	NC_017647	GCT	2	6	8009	8014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627447
137	NC_017647	GC	3	6	8028	8033	0 %	0 %	50 %	50 %	386627447
138	NC_017647	CTGG	2	8	8045	8052	0 %	25 %	50 %	25 %	386627447
139	NC_017647	GTG	2	6	8229	8234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627447
140	NC_017647	CTG	2	6	8235	8240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627447
141	NC_017647	CTGG	2	8	8246	8253	0 %	25 %	50 %	25 %	386627447
142	NC_017647	GTG	2	6	8268	8273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627447
143	NC_017647	CTT	2	6	8291	8296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386627447
144	NC_017647	TGG	2	6	8362	8367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627447
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149	NC_017647	GCG	2	6	8501	8506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627447
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154	NC_017647	GGC	2	6	8712	8717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627448
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160	NC_017647	TGG	2	6	9064	9069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627448
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169	NC_017647	CTG	2	6	9575	9580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627449
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248	NC_017647	CAG	2	6	13293	13298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627452
249	NC_017647	CAT	2	6	13334	13339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386627452
250	NC_017647	GTG	2	6	13362	13367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627452
251	NC_017647	GCG	3	9	13374	13382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627452
252	NC_017647	GGT	2	6	13446	13451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627452
253	NC_017647	AGC	3	9	13453	13461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627452
254	NC_017647	GT	4	8	13462	13469	0 %	50 %	50 %	0 %	386627452
255	NC_017647	CCG	2	6	13494	13499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386627452
256	NC_017647	AGC	2	6	13546	13551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627452
257	NC_017647	GAG	2	6	13677	13682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386627452
258	NC_017647	CGG	2	6	13721	13726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627453
259	NC_017647	AGA	2	6	13749	13754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386627453
260	NC_017647	GGC	2	6	13788	13793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627453
261	NC_017647	G	6	6	13876	13881	0 %	0 %	100 %	0 %	386627453
262	NC_017647	A	6	6	13918	13923	100 %	0 %	0 %	0 %	386627453
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381	NC_017647	GT	3	6	21549	21554	0 %	50 %	50 %	0 %	386627463
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388	NC_017647	CGTTA	2	10	21886	21895	20 %	40 %	20 %	20 %	386627463
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